Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms