Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tubb1A2AQ07 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tubb1A2AQ07 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tubb1A2AQ07 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tubb1A2AQ07 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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