Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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