Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms