Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms