Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms