Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms