Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms