Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tspan3Q9QY33 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan3Q9QY33 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms