Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr9Q9EQU3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tlr9Q9EQU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms