Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdrd12Q9CWU0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd12Q9CWU0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms