Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smyd3Q9CWR2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smyd3Q9CWR2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smyd3Q9CWR2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms