Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp1Q8K021 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp1Q8K021 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scamp1Q8K021 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms