Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ift52Q62559 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift52Q62559 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ift52Q62559 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ift52Q62559 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ift52Q62559 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ift52Q62559 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ift52Q62559 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ift52Q62559 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ift52Q62559 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ift52Q62559 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ift52Q62559 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ift52Q62559 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ift52Q62559 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ift52Q62559 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ift52Q62559 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ift52Q62559 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ift52Q62559 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ift52Q62559 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ift52Q62559 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift52Q62559 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ift52Q62559 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ift52Q62559 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift52Q62559 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift52Q62559 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift52Q62559 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift52Q62559 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ift52Q62559 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift52Q62559 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift52Q62559 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift52Q62559 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift52Q62559 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift52Q62559 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift52Q62559 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift52Q62559 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift52Q62559 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift52Q62559 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms