Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema4aQ62178 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4aQ62178 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms