Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncor1Q60974 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncor1Q60974 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncor1Q60974 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncor1Q60974 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncor1Q60974 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncor1Q60974 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncor1Q60974 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncor1Q60974 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncor1Q60974 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncor1Q60974 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncor1Q60974 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncor1Q60974 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncor1Q60974 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncor1Q60974 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncor1Q60974 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncor1Q60974 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms