Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2dQ60773 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2dQ60773 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2dQ60773 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms