Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdp2Q504M2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdp2Q504M2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdp2Q504M2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms