Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
F13bQ07968 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
F13bQ07968 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
F13bQ07968 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F13bQ07968 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F13bQ07968 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F13bQ07968 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F13bQ07968 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
F13bQ07968 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
F13bQ07968 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
F13bQ07968 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
F13bQ07968 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F13bQ07968 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms