Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col6a2Q02788 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col6a2Q02788 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col6a2Q02788 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms