Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
AlkP97793 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
AlkP97793 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
AlkP97793 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
AlkP97793 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AlkP97793 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AlkP97793 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AlkP97793 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AlkP97793 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
AlkP97793 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AlkP97793 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
AlkP97793 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
AlkP97793 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
AlkP97793 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
AlkP97793 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
AlkP97793 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
AlkP97793 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
AlkP97793 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
AlkP97793 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
AlkP97793 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
AlkP97793 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
AlkP97793 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
AlkP97793 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
AlkP97793 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
AlkP97793 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
AlkP97793 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
AlkP97793 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
AlkP97793 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
AlkP97793 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
AlkP97793 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
AlkP97793 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
AlkP97793 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
AlkP97793 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
AlkP97793 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
AlkP97793 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
AlkP97793 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
AlkP97793 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
AlkP97793 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
AlkP97793 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
AlkP97793 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
AlkP97793 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
AlkP97793 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
AlkP97793 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
AlkP97793 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
AlkP97793 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
AlkP97793 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
AlkP97793 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
AlkP97793 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
AlkP97793 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
AlkP97793 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
AlkP97793 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
AlkP97793 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
AlkP97793 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
AlkP97793 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
AlkP97793 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
AlkP97793 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
AlkP97793 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
AlkP97793 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
AlkP97793 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
AlkP97793 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
AlkP97793 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
AlkP97793 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
AlkP97793 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
AlkP97793 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
AlkP97793 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
AlkP97793 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
AlkP97793 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
AlkP97793 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
AlkP97793 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
AlkP97793 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
AlkP97793 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
AlkP97793 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
AlkP97793 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
AlkP97793 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
AlkP97793 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
AlkP97793 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
AlkP97793 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
AlkP97793 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
AlkP97793 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
AlkP97793 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
AlkP97793 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
AlkP97793 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
AlkP97793 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
AlkP97793 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
AlkP97793 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
AlkP97793 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
AlkP97793 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
AlkP97793 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
AlkP97793 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
AlkP97793 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
AlkP97793 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
AlkP97793 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
AlkP97793 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
AlkP97793 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
AlkP97793 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
AlkP97793 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
AlkP97793 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
AlkP97793 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
AlkP97793 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
AlkP97793 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.6 ms