Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctbp2P56546 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctbp2P56546 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms