Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox17P56394 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox17P56394 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox17P56394 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox17P56394 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox17P56394 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox17P56394 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox17P56394 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox17P56394 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms