Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1P29341 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc1P29341 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1P29341 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms