Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tnni2P13412 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tnni2P13412 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tnni2P13412 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,7 ms