Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl1P12850 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl1P12850 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl1P12850 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms