Protein–RNA interactions for Protein: O70338

Rnaseh1, Ribonuclease H1, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh1O70338 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnaseh1O70338 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnaseh1O70338 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnaseh1O70338 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnaseh1O70338 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms