Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp2b1G5E829 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b1G5E829 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms