Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700067P10RikG3X8U2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700067P10RikG3X8U2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700067P10RikG3X8U2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms