Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XntrpcF8VQM8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XntrpcF8VQM8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XntrpcF8VQM8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms