Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd7E9Q9W7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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