Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfap70D3YVL2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfap70D3YVL2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap70D3YVL2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap70D3YVL2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfap70D3YVL2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms