Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxpe3B9EKK6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxpe3B9EKK6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms