Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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