Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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