Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms