Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgr5Q9Z1P4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms