Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cib1Q9Z0F4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms