Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf2Q9WTU0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms