Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NrkQ9R0G8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms