Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms