Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripk3Q9QZL0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms