Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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