Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms