Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms