Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rabgef1Q9JM13 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rabgef1Q9JM13 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rabgef1Q9JM13 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rabgef1Q9JM13 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rabgef1Q9JM13 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rabgef1Q9JM13 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rabgef1Q9JM13 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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