Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Higd1aQ9JLR9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Higd1aQ9JLR9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Higd1aQ9JLR9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Higd1aQ9JLR9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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