Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trem1Q9JKE2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trem1Q9JKE2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trem1Q9JKE2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trem1Q9JKE2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trem1Q9JKE2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms