Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms