Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms